Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL2P13500 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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