Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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