Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms