Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG7O95352 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG7O95352 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms