Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXO3O43524 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms