Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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