Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms