Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRTO14522 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRTO14522 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRTO14522 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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