Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms