Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLDN25C9JDP6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLDN25C9JDP6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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