Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms