Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RIMBP3BA6NNM3 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP3BA6NNM3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms