Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms