Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms