Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms