Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms