Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms