Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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COPS3Q9UNS2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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COPS3Q9UNS2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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COPS3Q9UNS2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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COPS3Q9UNS2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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COPS3Q9UNS2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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COPS3Q9UNS2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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COPS3Q9UNS2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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