Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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