Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms