Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms