Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms