Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms