Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCDH10Q9P2E7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms