Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms