Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms