Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLIRPQ9GZT3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLIRPQ9GZT3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLIRPQ9GZT3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLIRPQ9GZT3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLIRPQ9GZT3 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLIRPQ9GZT3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLIRPQ9GZT3 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLIRPQ9GZT3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SLIRPQ9GZT3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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