Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms