Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms