Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUS3Q9BZE2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUS3Q9BZE2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms