Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM54Q9BYV2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM54Q9BYV2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM54Q9BYV2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM54Q9BYV2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM54Q9BYV2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM54Q9BYV2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM54Q9BYV2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM54Q9BYV2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM54Q9BYV2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM54Q9BYV2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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