Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms