Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms