Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms