Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms