Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms