Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms