Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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