Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2BQ99453 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms