Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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RNF185Q96GF1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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RNF185Q96GF1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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RNF185Q96GF1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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RNF185Q96GF1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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RNF185Q96GF1 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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RNF185Q96GF1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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RNF185Q96GF1 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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RNF185Q96GF1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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