Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD50Q92878 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD50Q92878 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD50Q92878 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD50Q92878 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD50Q92878 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD50Q92878 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD50Q92878 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD50Q92878 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD50Q92878 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD50Q92878 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD50Q92878 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms