Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ATG4AQ8WYN0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ATG4AQ8WYN0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ATG4AQ8WYN0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ATG4AQ8WYN0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ATG4AQ8WYN0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ATG4AQ8WYN0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ATG4AQ8WYN0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ATG4AQ8WYN0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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ATG4AQ8WYN0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4AQ8WYN0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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