Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLHC1Q8NHS4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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