Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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