Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF550Q7Z398 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF550Q7Z398 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF550Q7Z398 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF550Q7Z398 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF550Q7Z398 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF550Q7Z398 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF550Q7Z398 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF550Q7Z398 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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