Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms