Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZD4Q76G19 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms