Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RFPL4BQ6ZWI9 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RFPL4BQ6ZWI9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms