Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VITQ6UXI7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VITQ6UXI7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms