Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CSAG1Q6PB30 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms